[linux] Re: "Most high-throughput bioinformatics work these days takes place on the Linux command line"

[Maarten Lips]

Heren,

Heeft er iemand verstand van Ubuntu 12.04 icm touchscreens? 

Gr

Maarten

> Op 15 mrt. 2016 om 19:15 heeft Willem Ligtenberg <willem op wligtenberg.nl> het volgende geschreven:
> 
> U vraagt, wij draaien. :)
> Genome assembler is een tool om vanuit stukjes DNA uit een sample van 
> een organisme, het volledige genoom op te bouwen. (door gebruik te maken 
> van de overlap tussen de verschillende stukjes)
> Read mappers, zijn tools welke stukjes RNA (het afgelezen DNA welke 
> gebruikt wordt om eiwitten mee te bouwen) te mappen op het genoom. Dan 
> weet je dus welke stukken actief zijn.
> Annotation tools, zijn belangrijk om deze informatie in hun context te 
> plaatsen. (bijvoorbeeld bij welk gen hoort dit en eventuele andere 
> informatie als geassocieerde ziekten)
> 
> Maar is op zich voor de commandline minder relevant. :)
> 
> Willem
> 
> PS: Ik ben zo'n Bioinformaticus. :)
> 
>> On 15-03-16 17:14, dick kampman wrote:
>> Ik lees onder meer "...genome assemblers, read mappers, and annotation
>> tools...". Kan iemand dat even uitleggen? Of is dat in het kader van de
>> command-line minder relevant?
>> 
>> Dick Kampman
>> dkampman op telfort.nl
>> 
>> 
>>> On 03/15/2016 03:44 PM, Paul Slootman wrote:
>>>> On Tue 15 Mar 2016, Hans Paijmans wrote:
>>>> 
>>>> Glasgow.LINUXworkflows.Aug15-19
>>>> 
>>>> Course:  Introduction to LINUX workflows for biologists
>>> http://prstatistics.com/course/introduction-to-linux-workflows-for-biologists-ilwb/
>>> 
>>> Leuk om te lezen :)
>>> 
>>> 
>>> Paul
> 
>