[linux] Re: "Most high-throughput bioinformatics work these days takes place on the Linux command line"

[Eric de Hont]

Bedankt voor de uitleg!

-- 
Groeten,
Eric

Op 15-03-16 om 18:58 schreef Willem Ligtenberg:
> U vraagt, wij draaien. :)
> Genome assembler is een tool om vanuit stukjes DNA uit een sample van
> een organisme, het volledige genoom op te bouwen. (door gebruik te maken
> van de overlap tussen de verschillende stukjes)
> Read mappers, zijn tools welke stukjes RNA (het afgelezen DNA welke
> gebruikt wordt om eiwitten mee te bouwen) te mappen op het genoom. Dan
> weet je dus welke stukken actief zijn.
> Annotation tools, zijn belangrijk om deze informatie in hun context te
> plaatsen. (bijvoorbeeld bij welk gen hoort dit en eventuele andere
> informatie als geassocieerde ziekten)
>
> Maar is op zich voor de commandline minder relevant. :)
>
> Willem
>
> PS: Ik ben zo'n Bioinformaticus. :)
>
> On 15-03-16 17:14, dick kampman wrote:
>> Ik lees onder meer "...genome assemblers, read mappers, and annotation
>> tools...". Kan iemand dat even uitleggen? Of is dat in het kader van de
>> command-line minder relevant?
>>
>> Dick Kampman
>> dkampman op telfort.nl
>>
>>
>> On 03/15/2016 03:44 PM, Paul Slootman wrote:
>>> On Tue 15 Mar 2016, Hans Paijmans wrote:
>>>
>>>> Glasgow.LINUXworkflows.Aug15-19
>>>>
>>>> Course:  Introduction to LINUX workflows for biologists
>>> http://prstatistics.com/course/introduction-to-linux-workflows-for-biologists-ilwb/
>>>
>>> Leuk om te lezen :)
>>>
>>>
>>> Paul
>>>
>>>
>